Vadovybė
Vadovai Senatas Taryba Patarėjai
Sąjungos
Darbuotojų profesinė sąjunga Studentų sąjunga Darbo taryba
Fakultetai ir institutai
Baltijos regiono istorijos ir archeologijos institutas Jūros technologijų ir gamtos mokslų fakultetas Jūros tyrimų institutas Socialinių ir humanitarinių mokslų fakultetas Sveikatos mokslų fakultetas
Tarnybos
Studijų tarnyba Mokslo ir inovacijų tarnyba Vidaus audito tarnyba Organizacijos aptarnavimo tarnyba
Skyriai
Komunikacijos ir rinkodaros skyrius Teisės ir viešųjų pirkimų skyrius Strateginės plėtros ir ekonomikos skyrius Finansų ir buhalterinės apskaitos skyrius
Centrai
Informacinių išteklių ir leidybos centras Paslaugų centras