• Dr. K. Pemkaus biblioteka–archyvas
• Anso Lymanto archyvas
• Viliaus Pėteraičio archyvas
• Vytauto Strolios kolekcija
• Retų spaudinių kolekcija
• Vlado Nausėdo kolekcija

KU bibliotekoje yra saugomos kelios kolekcijos.

Retų spaudinių, kolekcijų ir rankraščių skyriuje saugoma didelė ir turtinga bibliofilo dr. K. Pemkaus kolekcija. Vertingos žymių Mažosios Lietuvos veikėjų A.Lymanto ir V. Pėteraičio kolekcijos. Šias kolekcijas sudaro knygos, periodika, archyvas (laiškai, nuotraukos ir kt.), kartografija ir kt.

2009 m. skyriaus fondą papildė išeivijoje gyvenusio muzikologo Vytauto Strolios archyvas.

KU Menų fakulteto bibliotekoje saugoma pedagogo, kultūros istoriko, vertėjo Vl. Nausėdo kolekcija.